Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV7

Setd5, SET domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd5Q5XJV7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Setd5Q5XJV7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setd5Q5XJV7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setd5Q5XJV7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setd5Q5XJV7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setd5Q5XJV7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setd5Q5XJV7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Setd5Q5XJV7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Setd5Q5XJV7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setd5Q5XJV7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setd5Q5XJV7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Setd5Q5XJV7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms