Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms