Protein–RNA interactions for Protein: Q3UCV8

Otulin, Ubiquitin thioesterase otulin, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtulinQ3UCV8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
OtulinQ3UCV8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtulinQ3UCV8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms