Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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GEN1Q17RS7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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GEN1Q17RS7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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GEN1Q17RS7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GEN1Q17RS7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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