Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGB3BPQ13352 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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