Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou6f1Q07916 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms