Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox13Q04891 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms