Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcad1Q04692 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms