Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff2Q03404 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms