Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SelpQ01102 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms