Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
rp9P97762 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
rp9P97762 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
rp9P97762 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
rp9P97762 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
rp9P97762 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
rp9P97762 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
rp9P97762 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
rp9P97762 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
rp9P97762 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
rp9P97762 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
rp9P97762 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
rp9P97762 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
rp9P97762 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
rp9P97762 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
rp9P97762 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
rp9P97762 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
rp9P97762 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
rp9P97762 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
rp9P97762 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
rp9P97762 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
rp9P97762 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
rp9P97762 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
rp9P97762 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
rp9P97762 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
rp9P97762 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
rp9P97762 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
rp9P97762 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
rp9P97762 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
rp9P97762 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
rp9P97762 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
rp9P97762 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
rp9P97762 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
rp9P97762 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
rp9P97762 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
rp9P97762 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
rp9P97762 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
rp9P97762 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
rp9P97762 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
rp9P97762 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
rp9P97762 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
rp9P97762 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
rp9P97762 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
rp9P97762 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
rp9P97762 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
rp9P97762 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
rp9P97762 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
rp9P97762 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
rp9P97762 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
rp9P97762 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
rp9P97762 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms