Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smyd1P97443 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms