Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx2P81066 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx2P81066 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms