Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ppfia3P60469 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ppfia3P60469 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ppfia3P60469 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ppfia3P60469 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms