Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox17P56394 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox17P56394 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms