Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RabggtbP53612 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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