Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg3P47867 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg3P47867 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scg3P47867 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms