Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apoc1P34928 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoc1P34928 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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