Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Hoxd10P28359 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
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