Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpcP21841 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms