Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rps6ka1P18653 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps6ka1P18653 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms