Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calb1P12658 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calb1P12658 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms