Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh3P10287 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms