Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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