Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1O88643 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1O88643 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1O88643 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1O88643 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pak1O88643 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms