Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb5O70309 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms