Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx4O55187 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms