Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg2O55111 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dsg2O55111 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms