Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21310J3QQ23 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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