Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10477F6SW83 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10477F6SW83 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10477F6SW83 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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