Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ifit3bE9PV48 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifit3bE9PV48 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifit3bE9PV48 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifit3bE9PV48 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifit3bE9PV48 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifit3bE9PV48 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms