Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms