Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30cD3YVI9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms