Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cspp1B2RX88 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms