Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc183A2AJB1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms