Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdccag3A2AIW0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdccag3A2AIW0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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