Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms