Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ZNF548Q8NEK5 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms