Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
R3HDM1Q15032 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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