Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RUNX3Q13761 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms