Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GDAP2Q9NXN4 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GDAP2Q9NXN4 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms