Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCBE1Q6UXH8 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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