Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTPAP49638 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTPAP49638 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTPAP49638 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms