Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms