Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms