Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 SSX6-201ENST00000376932 562 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4EBP2P2-201ENST00000563883 333 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL835P-201ENST00000579920 262 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC118757.1-202ENST00000589074 609 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 U47924.1-201ENST00000606539 434 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1A1P5-201ENST00000436459 1389 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 SS18L2P1-201ENST00000445923 213 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms