Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms