Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms