Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SS18Q15532 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms