Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCIRG1Q13488 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms